1.1. Особенности развития медицинской микробиологии на современном этапе
1.2. Морфология и классификация эукариот, прокариот, акариот. Фенотипическая и генотипическая систематика. Молекулярная филогенетика.
1.3. Современные методы микробиологических исследований (бактериологических, вирусологических, микологических, паразитологических) в диагностике инфекционных и паразитарных болезней
1.4. Современные представления о микробиоте, микробиоме и метаболоме
1.5. Антимикробные и противопаразитарные лекарственные средства
1.6. Эпидемиология инфекционных и паразитарных болезней. Молекулярная эпидемиология

2.1. Основные принципы и механизмы функционирования иммунной системы

3.1. Вопросы этики и деонтологии в профессиональной деятельности врача — медицинского микробиолога
3.2. Психологические, социологические закономерности и принципы межличностного взаимодействия в коллективе, междисциплинарные консилиумы

4.1. Основные биологические угрозы
4.2. Нормативно-правовое обеспечение микробиологических исследований

5.1. Общая медицинская бактериология
5.2. Грамположительные кокки: клиническое значение, характеристика, общие подходы к идентификации аэробных грамположительных кокков
5.3. Грамположительные палочки: клиническое значение, характеристика, общие подходы к идентификации аэробных грамположительных палочек
5.4. Грамотрицательные аэробные и факультативно-анаэробные бактерии: клиническое значение, характеристика, общие подходы к идентификации
5.5. Анаэробные бактерии: клиническое значение, характеристика, общие подходы к идентификации
5.6. Спиралевидные грамотрицательные палочки: клиническое значение, характеристика, общие подходы к идентификации
5.7. Облигатные внутриклеточные бактерии: клиническое значение, характеристика, подходы к идентификации
5.8. Антибиотики
5.9. Методы определения чувствительности бактерий к антибиотикам

6.1. Общая медицинская вирусология
6.2. Методы культивирования вирусов и модельные системы в вирусологии
6.3. Основные принципы лабораторной диагностики вирусных инфекций, индикации и идентификации вирусов
6.4. Частная вирусология

7.1. Общая медицинская микология
7.2. Лабораторная диагностика кандидоза
7.3. Лабораторная диагностика криптококкоза
7.4. Редкие дрожжи — возбудители микозов
7.5. Диагностика Malassezia-ассоциированных инфекций
7.6. Лабораторная диагностика мукормикоза
7.7. Лабораторная диагностика аспергиллеза
7.8. Лабораторная диагностика гиалогифомикоза
7.9. Возбудители хромомикоза и феогифомикоза
7.10. Дерматомицеты — основные возбудители микозов кожи и ее придатков
7.11. Диморфные грибковые патогены.
7.12. Некультивируемые патогенные грибы и грибоподобные организмы

8.1. Общие вопросы медицинской паразитологии и лабораторной диагностики паразитарных инвазий
8.2. Лабораторная диагностика кишечных протозоозов (протозойные болезни, передающиеся фекально-оральным путем)
8.3. Лабораторная диагностика тканевых и трансмиссивных протозоозов
8.4. Лабораторная диагностика кишечных гельминтозов
8.5. Лабораторная диагностика тканевых паразитозов
8.6. Патология, вызываемая паразитированием насекомых и клещей

9.1. Этапы диагностического процесса в клинической микробиологии
9.2. Микробиологическая диагностика инфекционных и паразитарных болезней (основные возбудители: бактерии, вирусы, грибы, простейшие и гельминты; правила сбора и транспортировки биологического материала, методы диагностики, особенности определения чувствительности к антимикробным препаратам, интерпретация результатов)

10.1. Возбудители особо опасных инфекций

11.1. Введение в санитарную микробиологию.
11.2. Санитарно-микробиологические исследования продукции.
11.3. Санитарная микробиология факторов среды обитания. Аллохтонная и автохтонная микробиота.

13.1. Прием материала, регистрация и выдача ответа
13.2. Микробиологическое исследование крови
13.3. Микробиологическое исследование биологического материала при инфекциях верхних дыхательных путей
13.4. Микробиологическое исследование биологического материала при инфекциях нижних дыхательных путей
13.5. Микробиологическое исследование мочи при инфекциях мочевых путей
13.6. Микробиологическое исследование СМЖ при инфекциях центральной нервной системы
13.7. Микробиологическое исследование других стерильных в норме биологических жидкостей
13.8. Микробиологическое исследование материала инфицированных ран
13.9. Микробиологическое исследование биологического материала при инфекциях репродуктивной системы
13.10. Идентификация бактерий и грибов методом MALDI-TOF-масс- спектрометрии
13.11. Обнаружение и идентификация бактерий, вирусов, грибов, простейших в биологическом материале методом ПЦР
13.12. Исследование чувствительности бактерий и грибов к антимикробным JIC методами: диско-диффузионным, градиентных кон-центраций и последовательных разведений, молекулярно-генетическими и физико-химическими (масс-спектрометрическим) 10
13.13. Интерпретация результатов микробиологического исследования и определения чувствительности к антимикробным JIC при инфекциях различных локализаций 2
13.14. Серологические исследования при диагностике инфекционных и паразитарных болезней
13.15. Микроскопическое исследование биологического материала на грибы
13.16. Микроскопическое исследование нативного материала (мокрота, СМЖ и другие биологические жидкости)
13.17. Идентификация культур грибов фенотипическими методами
13.18. Методы индикации и идентификации вирусов
13.19. Работа с культурой клеток. Титрование вирусов. Реакция нейтрализации инфекционное™.
13.20. Микроскопическое исследование биологического материала на наличие трофозоитов и цист кишечных простейших
13.21. Микроскопическое исследование крови на наличие паразитов (возбудителей малярии, бабезиоза, филяриозов)
13.22. Микроскопическое исследование биологического материала на наличие возбудителей тканевых протозоозов (лейшманиозов, трипаносомозов)
13.23. Микроскопическое исследование биологического материала на наличие яиц и личинок гельминтов
13.24. Санитарно-микробиологические исследования пищевой и непродовольственной продукции и факторов среды обитания